Dr. Warnock'un 1982'de Charles Geschke ile birlikte kurduğu yazılım şirketi Adobe, John Warnock'un 5 Ağustos Cumartesi günü ailesiyle çevrili bir şekilde hayatını kaybettiğini duyurdu.
1984 yılında, şirketin ilk ürünü olan Adobe PostScript ortaya çıktı. Adobe PostScript, kullanıcıların metin ve grafikleri dijital belgeler halinde biçimlendirmesine ve ardından bunları PostScript'i destekleyen herhangi bir yazıcıda aynı şekilde yazdırmasına izin verdi. Şirket daha sonra diğer şeylerin yanı sıra PDF dosya biçimini ve Acrobat Reader yazılımını geliştirecek ve bunu Adobe Photoshop, Illustrator ve Premiere Pro gibi önde gelen medya düzenleme yazılımlarına genişletecekti.
Warnock, 2000 yılına kadar Adobe'nin CEO'su olarak görev yaptı. Ayrıca 2001 yılına kadar baş teknik sorumlu olarak görev yaptı ve 2017 yılına kadar yönetim kurulu eş başkanı olarak kaldı; bu görevi iki yıl önce vefat eden kurucu ortak Charles Geschke ile paylaştı. Adobe CEO'su Shantanu Narayen, şirket çalışanlarına gönderdiği bir e-postada, "John, neslimizin en büyük mucitlerinden biri olarak kabul edilmektedir." "John ile son 25 yıldaki etkileşimlerim, profesyonel kariyerimin zirvesi oldu."